【2026年最新】Shopify運用代行おすすめ16社を比較｜費用相場・選び方をタイプ別に解説

Shopify運用代行は、「どこまで任せたいか」で選ぶべき会社が変わります。構築から物流まで丸ごと任せるのか、日々の運営や集客だけを頼むのか、サイトの改修を頼みたいのか。

本記事では、おすすめの16社を「総合型」「運営代行・集客支援型」「制作・カスタマイズ型」の3タイプで紹介し、公開料金の例やパートナー階層（2026年9月時点）、運用代行会社の選び方も解説します。
依頼先を比較する際の参考にしてください。

Shopify運用代行とは？制作代行との違い

Shopify運用代行とは、Shopifyで構築したECサイトの公開後の運営業務を、外部の専門会社に任せるサービスです。まずは運用代行が担う範囲と、制作代行との違いを整理します。

Shopify運用代行が担当する範囲

運用代行が担当するのは、ECサイトの公開後に毎日・毎月発生する業務です。たとえば、商品登録や商品ページの更新、バナーや特集ページの作成、メルマガ配信、アクセス解析と改善提案などが挙げられます。

会社によっては、受注管理やカスタマーサポート、広告運用、商品の保管・発送といった物流業務まで対応しています。どこまでを依頼範囲に含められるかは会社ごとに異なるため、比較する際は対応範囲を必ず確認しましょう。

制作代行・構築代行との違い

制作代行（構築代行）は、Shopifyストアを立ち上げるまでの作業を依頼するサービスです。デザインやテーマのカスタマイズ、アプリの選定、初期設定などを行ない、サイトの公開をもってひと区切りとなります。

一方の運用代行は、公開後の運営を継続的に支援するサービスです。そのため料金も、制作代行は一括の制作費、運用代行は月額費用で契約する形が一般的です。

これからストアを立ち上げる段階の方は、制作会社の比較記事もあわせてご覧ください。

Shopify運用代行のサービス内容

Shopify運用代行にはさまざまなサービスがあります。多くの会社では、運用作業だけでなく、改善提案や戦略立案まで含めた「Shopifyコンサル」としての支援を行っています。まずは、Shopify運用代行のサービス内容を見ていきましょう。

サイトのセットアップとカスタマイズ

サイトのセットアップでは、Shopifyストアの基本設定を行ないます。これには、商品の登録、支払いや配送方法の設定、ドメインの設定などが含まれます。

一方、カスタマイズでは、サイトの見た目や機能を自社のニーズに合わせて調整します。テーマの選択や編集、アプリの導入などもカスタマイズに含まれ、自社のオリジナルのサイトのイメージを構築していきます。

また、業種や商材に合わせた構成・導線の改善提案を行うなど、コンサル的な視点で支援するケースもあります。

マーケティングとプロモーション

マーケティングやプロモーションは、ECサイトを成功に導く上での重要な要素です。これらのサービスは顧客の関心を惹きつけ、商品の購入に繋げるためのものです。EC業界の最新トレンドを常に把握し、それを活用したマーケティング戦略を策定していきます。これには、ユーザーの行動や購入傾向を正確に分析し、サイトの改善点を見つけ出し改善を加える場合もあります。このような分析・改善提案は、Shopifyコンサルティングの一環として提供されることも多いです。

プロモーションではソーシャルメディアを活用して商品やサービスを広めます。必要に応じて顧客にメールを送信し、新商品の宣伝をしたり顧客のリピート購入を促したりします。

ウェブサイトのパフォーマンス分析

パフォーマンス分析とは、サイトに訪れたユーザーの行動やパフォーマンスなどを分析し、サイトの改善点を見つけ出すことです。これにより、どのページに関心があるのか、どこでページを離脱しているのかも把握できます。必要に応じてサイトのロード時間やレスポンス時間を測定して、ユーザー体験を向上させるための改善点を見つける場合もあります。

パフォーマンス分析を行ない、必要な対策をとることで、ユーザーの離脱を防ぎ、新規購入に繋げられる可能性が高まります。
単なる数値確認にとどまらず、課題抽出や改善方針の提案まで行う点が、コンサル型支援の特徴です。

注文管理とカスタマーサポート

注文管理では、注文状況の把握、注文の検索や表示、注文データのエクスポートなど、注文に関わる業務を一元管理します。

カスタマーサポートでは問い合わせの対応やトラブルが発生した際のサポートを行ないます。

これらのサービスを行なうことで、業務の効率化を実現します。加えて、顧客に対し、適切で迅速なサポートを行なうことで、顧客満足度の向上にも繋げられるでしょう。

物流代行業務

物流代行業務は、商品の保管や梱包、発送など、物流に関わる業務を代行するサービスです。注文を受けて梱包や発送を適切に行ない、発送します。

加えて、商品の在庫状況も一元的に管理し、在庫切れを防ぎます。このサービスを利用することで、物流業務の負担を軽減し、ECサイトの運営を効率的に行なうことが可能となるでしょう。
物流体制の最適化についても、コンサル視点で提案されるケースがあります。

Shopify運用代行のメリット

Shopify運用代行を利用することで、多くのメリットが生じます。ここからは、Shopify運用代行を利用するメリットについて解説します。

専門知識を活用できる

運用代行サービスを利用すれば、自社に専門知識をもつ人材がいなくても、専門知識を活用したECサイト運営が可能となります。

これは、Shopifyの運用代行業者には、ShopifyでのECサイト構築に関するノウハウをもった人材が多く在籍しているためです。

これにより、ECサイト構築から分析、カスタマーサポートまで安心して任せることができます。

サイトの品質向上につながる

Shopifyの運用代行業者には、高度な知識をもつプロフェッショナルが多く在籍していることから、サイトの設計や運用が最適化され、サイトの品質が向上するというメリットがあります。

プロのサポートを受けることにより、データ分析から最新のトレンドを把握でき、ECサイト品質向上のための効果的な、マーケティング戦略の策定が可能となるでしょう。

効率よく成果を出せる

Shopifyの運用代行業者を利用することで、効率よく成果を出せる可能性があります。

それは、代行業者は、Shopify運用に関する知見をもったプロフェッショナルであることから、効果的なマーケティング戦略の立案と実行が可能になるためです。

これにより、ECサイトの構築から運営までがスムーズに行なえることに加え、効率よく成果を出すことが可能となります。

ほかの業務に集中できる

Shopify運用代行を利用することで、ほかの業務に集中できるというメリットがあります。

Shopifyを運用するには、商品のリストアップや在庫管理、顧客対応など多くの業務をこなさなければなりません。これらの業務を自社で行なうと、人的リソースが分散してしまい、本来重視すべき業務に集中できなくなる可能性があります。

そこで、運用代行を利用すると、企業は商品開発やマーケティングなど、ほかの重要な業務に専念することが可能となります。このメリットを活かし、自社の業務に集中することで、ビジネスの成長にもつなげていけるでしょう。

運用コストの削減につながる

Shopify運用代行は、運用コストの削減につなげられます。

自社で運用を行なうと、人材の雇用や教育、システムの更新や保守などに、多くのコストが発生します。運用代行を利用すれば、これらのコストを大幅に削減できます。

Shopifyに関するプロが運用することから、コストを抑えながらより高品質なサービスを提供することも可能となります。

Shopify運用代行のデメリット

Shopify運用代行には多くのメリットがある一方で、注意しておきたい点もあります。契約前に把握しておきたいデメリットを3つご紹介します。

月額費用が継続的に発生する

運用代行を利用すると、任せる業務の範囲に応じた月額費用が継続的に発生します。最低契約期間を設けている会社もあり、公開されている例では3ヶ月〜6ヶ月程度です。

予算内に費用が収まるかを確認したうえで、依頼する範囲を絞り込んだり、複数の会社を比較したりすることをおすすめします。”

社内にノウハウが蓄積しにくい

運営業務を丸ごと外部に任せると、施策の意図や数値の見方が社内に残りにくくなります。

将来的に内製化を考えている場合は、月次のレポートや定例ミーティングを通じて、施策の内容や結果を共有してもらえるかを確認しておきましょう。一部の業務をあえて社内に残しておくのもひとつの方法です。”

自社の判断ですぐに修正しにくい

運用代行を利用すると、サイトの更新作業を代行会社経由で行なうことになるため、自社で自由に調整できる範囲が限られる場合があります。

急ぎの修正にどこまで対応してもらえるか、自社で触ってよい範囲はどこかを、契約前に取り決めておくと安心です。

Shopify運用代行の費用相場

Shopify運用代行の費用は、依頼する業務の範囲や作業量によって大きく変わります。料金を公開していない会社も多いため、ここでは公式サイトで料金を公開している会社の例をもとに、費用の目安をご紹介します（2026年9月時点）。

会社名	プラン	月額	最低契約期間	主な内容
オタツー	定額EC運営代行「ライト」	5万円（税込5万5,000円）	3ヶ月	チャットサポート、商品ページ更新、画像加工、バナー設置、クーポン発行など
オタツー	ECコンサル	15万円〜	記載なし	分析・課題抽出、改善施策の立案
セルフプラス	Shopify運用支援	20万〜80万円（税別）※初期費用30万円	3ヶ月	AIが担当する作業量を人手に換算した工数（月125〜600時間）で金額が決まる
アートトレーディング	Shopify運用代行プラン	30万円（税抜）〜	6ヶ月〜	月1回のMTG、アクセス解析・レポート作成、改善施策の提案、サイトの更新・商品登録

※2026年9月24日時点で各社の公式サイトに掲載されている内容です。最新の料金は各社にご確認ください。

出典：
https://ota2.jp/ec-subscription/
https://self-plus.co.jp/pricing/shopify-ai-growth/
https://art-trading.co.jp/shopify-service/

料金の決まり方

運用代行の料金は、主に「依頼する業務の範囲」と「作業量」で決まります。商品ページの更新やバナーの設置といった作業だけを依頼するのか、分析や改善提案、広告運用まで含めるのかによって、月額は大きく変わります。

料金体系も会社によって異なります。作業内容ごとに決まった定額プラン、月の作業量（工数）で金額が決まるプラン、課題やサイトの規模を聞いたうえで個別に見積もるケースなどがあります。”

一部の作業だけ依頼する場合の料金例

商品ページの更新や画像加工、バナーの設置など、日々の作業の一部だけを依頼する場合は、月額数万円から利用できるプランがあります。

たとえばオタツーの定額EC運営代行「ライト」プランは、月額5万円（税込5万5,000円）・3ヶ月契約で、チャットサポートや商品ページの更新、クーポン発行などを依頼できます。

＊参考　https://ota2.jp/ec-subscription/

分析・改善まで含めて任せる場合の料金例

アクセス解析や改善提案、月次の定例ミーティングまで含めて任せる場合は、月額20万〜30万円程度から始まるプランが公開されています。

アートトレーディングのShopify運用代行プランは月額30万円（税抜）からで、契約期間は6ヶ月からです。セルフプラスのShopify運用支援は、人手に換算した月の工数に応じて、月額20万〜80万円（税別）の4つのプランに分かれています。

＊参考　https://art-trading.co.jp/shopify-service/
＊参考　https://self-plus.co.jp/pricing/shopify-ai-growth/

初期費用と最低契約期間の目安

月額費用とは別に、初期費用がかかる場合があります。たとえばセルフプラスでは、初期診断や計測環境の整備などを含む初期費用として30万円（税別）が設定されています。

また、最低契約期間を設けている会社もあります。公開されている例では、オタツーの「ライト」プランとセルフプラスが3ヶ月、アートトレーディングとasnaro（アスナロ）が6ヶ月からです。月額だけでなく「月額×最低契約期間＋初期費用」の総額で比較しましょう。

Shopifyの利用料など、運用代行以外にかかる費用は以下の記事で解説しています。

＊参考　https://self-plus.co.jp/pricing/shopify-ai-growth/
＊参考　https://asnaro7676.com/service/ecsite-production/

Shopify運用代行会社の選び方

自社に合うShopify運用代行会社を選ぶには、まず任せたい範囲を決め、そのうえで実績や契約条件を順に確認していくと、依頼先選びの失敗を防げます。ここからは、運用代行会社を選ぶ際のポイントを6つ解説します。

任せたい範囲からタイプを決める

Shopify運用代行会社は、得意とする領域によって大きく3つのタイプに分けられます。自社の課題に合うタイプを先に決めておくと、比較する会社を絞り込めます。

タイプ	主な対応範囲	向いている企業
総合型	サイトの構築・運営から、受注管理、カスタマーサポート、物流まで一括で対応	EC担当者が少なく、運営業務をまとめて任せたい企業
運営代行・集客支援型	商品登録やページ更新などの運営作業、広告・SNS・モール運営などの集客支援	サイトはあるが、日々の運営や売上づくりの人手が足りない企業
制作・カスタマイズ型	テーマのカスタマイズ、アプリ開発、外部システムとの連携など技術面の対応	機能の追加や改修を継続的に依頼したい企業

本記事の後半では、16社をこの3タイプに分けてご紹介しています。

物流・カスタマーサポートまで任せられるか

ECの運営では、サイトの更新だけでなく、受注処理や問い合わせへの対応、商品の保管・梱包・発送といった業務も発生します。これらを別々の会社に依頼すると、在庫や出荷の情報をやり取りする手間が増えてしまいます。

出荷件数が多い企業や、物流まで含めて社内の業務を減らしたい企業は、受注管理やカスタマーサポート、物流代行まで対応できる会社を選ぶと、窓口をひとつにまとめられます。

Shopifyに関する知識が豊富か

Shopifyの運用代行を選ぶ際には、その会社がShopifyに関する豊富な知識を持っているかどうかを確認することが重要です。

豊富な知識があれば、Shopifyの機能を最大限に活かしたECサイト構築が可能となります。

自由にカスタマイズを行なうことで、自社のブランドイメージに合った独自性の高いECサイトの構築ができるでしょう。

Shopifyパートナー階層を確認する

Shopifyに関する知識や実績を見極める目安のひとつが、Shopifyのパートナー階層です。Shopifyのサービスパートナーは、実績などの要件に応じて「Registered」「Select」「Plus」「Premier」「Platinum」の5つの階層に分けられています。

各社の階層は、Shopify公式の「Partner Directory」で確認できます。階層は評価によって見直されるため、依頼する前に最新の状況を確認しておきましょう。

なお、Directoryで表示されない場合でも、パートナーでないとは限りません。階層はあくまで目安のひとつなので、自社が任せたい業務に対応しているかどうかとあわせて判断しましょう。

＊参考　https://www.shopify.com/partners/blog/updates-to-the-shopify-partner-program
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory

商品の業界知識が豊富か

Shopifyの運用代行業者を選ぶ際には、その業者が商品の業界知識を持っているか確認するようにしましょう。業界について深く理解していることは、マーケティング戦略を立てる上で大変重要だからです。

例えば、アパレル業界は、流行の変化が激しいため、ユーザーの購買行動を把握したうえで、ユーザーのニーズに合わせて、サイトのデザインやアプローチの仕方を変更する必要があります。そのため、業界知識が豊富であることは、ECサイトの売上に繋がる重要な要素といえます。

契約期間と料金体系を事前に確認する

運用代行は継続して契約するサービスです。料金だけでなく、契約条件まで見ておく必要があります。

特に、最低契約期間、月額に含まれる作業の範囲、範囲外の作業を依頼したときの費用、解約の条件は、契約前に確認しておきましょう。あわせて、レポートや定例ミーティングの頻度も確認しておくと、依頼した後のすれ違いを防げます。

おすすめのShopify運用代行会社16社の比較一覧

ここからは、Shopify運用代行でおすすめの会社16社をご紹介します。まずは各社のタイプとShopifyパートナー階層を一覧で確認しましょう。

会社名	タイプ	Shopifyパートナー階層（2026年9月時点）
CIN GROUP（asnaro）	総合型	Plus
トランスコスモス	総合型	Premier
アートトレーディング	総合型	Plus
コマースメディア	総合型	Premier
AnyMind Group	総合型	Premier
ごえん	総合型	Partner Directoryで確認できず
いつも	運営代行・集客支援型	Partner Directoryで確認できず
エスアンドティーパートナーズ	運営代行・集客支援型	Partner Directoryで確認できず
セルフプラス	運営代行・集客支援型	Plus
オタツー	運営代行・集客支援型	Partner Directoryで確認できず
サヴァリ	運営代行・集客支援型	Partner Directoryで確認できず
世界へボカン	運営代行・集客支援型	Select
GMOグローバルEC	運営代行・集客支援型	Partner Directoryで確認できず
飛躍	制作・カスタマイズ型	Premier
フォーミックス	制作・カスタマイズ型	Partner Directoryで確認できず
アユース	制作・カスタマイズ型	Partner Directoryで確認できず

※パートナー階層は、2026年9月24日時点でShopify Partner Directoryを確認したものです。

＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory

【総合型】構築から物流まで任せられるShopify運用代行会社6選

総合型は、サイトの構築・運営から受注管理、カスタマーサポート、物流まで、ECに関わる業務をまとめて依頼できる会社です。EC専任の担当者が少ない企業や、複数の委託先をひとつにまとめたい企業にとって、心強い選択肢です。

CIN GROUP（asnaro）

CIN GROUPは、「多くの人々の笑顔のために感動を届ける」を経営理念に掲げ、様々なサービスを展開しています。その中でも、「asnaro」ではECサイト構築における課題解決をトータルに提供し、自社ブランドを含むEC運営ノウハウと多様な物流ネットワークを持ち合わせています。

同社では、ECサイト制作から、集客・売上UP・顧客満足度向上など、それらを伸ばし続けるための広告運用サービスの提案、ECサイト構築・運用、マーケティング施策の立案まで、一貫したサービスを提供しています。

また、ECサイトの構築費用よりも、広告運用やサービス改善にリソースをかけるべきという考えから、ECサイト制作にかかる費用が他社と比べて抑えられているのも、同社の魅力の一つです。
asnaro（アスナロ）は、Shopifyのパートナー階層で「Plus Partner」に位置付けられています（2026年9月時点）。多様な物流ネットワークを活かし、受注管理やカスタマーサポート、商品の保管・発送まで含めて依頼できるため、EC運営の窓口をひとつにまとめたい企業におすすめです。

会社概要

会社名	株式会社CIN GROUP
設立	2012年7月
会社所在地	〒141-0032 東京都品川区大崎1-2-2 アートヴィレッジ大崎セントラルタワー9F
会社URL	https://asnaro7676.com/service/ecsite-production/
制作実績例	アパレル販売、化粧品・コスメ販売、フラワー販売、食品販売
Shopifyパートナー階層	Plus Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/cin-ec

トランスコスモス

トランス・コスモス株式会社は、Shopifyのパートナー階層で「Premier Partner」に位置付けられている企業です（2026年9月時点）。2022年には、Shopify Japanによる「Shopify Partner of the Year 2022 – Japan」で「Plus Partner of the Year」を受賞しています。

Shopifyを軸に、EC戦略のコンサルティング、WebやSNSでの集客、サイトの構築・運用、物流までを一社で請け負っています。既存のアプリで足りない機能は、カスタムアプリの開発で補えます。大規模サイトの要件にも応えやすい体制です。

会社概要

会社名	トランス・コスモス株式会社
設立	1985年6月18日
会社所在地	〒170-6016 東京都豊島区東池袋3-1-1 サンシャイン60
会社URL	https://www.trans-cosmos.co.jp/
制作実績例	味の素グループ、オンワードデジタルラボ、Meiji Seika ファルマ
Shopifyパートナー階層	Premier Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://www.trans-cosmos.co.jp/company/information/companyinfo.html
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/3986
＊参考　https://www.shopify.com/jp/blog/partner-of-the-year-japan-winners

アートトレーディング

Shopify運用代行プランの料金を月額30万円（税抜）から公開しているのが、アートトレーディング株式会社です。契約期間は6ヶ月からです。Shopifyのパートナー階層では「Plus Partner」に位置付けられています（2026年9月時点）。

ECコンサルティングと運営代行を組み合わせ、戦略設計からShopifyサイトの制作・リニューアル、日々の運営までを支援しています。強みは物流です。埼玉県所沢市にフルフィルメントセンターを構えており、ささげ業務やラッピングなど、物流まわりの業務もあわせて依頼できます。

運営と物流をまとめて外に出したい企業なら、有力な候補になるでしょう。

会社概要

会社名	アートトレーディング株式会社
設立	1996年1月12日
会社所在地	〒170-0013 東京都豊島区東池袋1-18-1 Hareza Tower 20F
会社URL	https://art-trading.co.jp/
制作実績例	神田胡蝶オンラインストア、PICOTIPICOTA、つむぎの館公式オンラインストア
Shopifyパートナー階層	Plus Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://art-trading.co.jp/company/
＊参考　https://art-trading.co.jp/shopify-service/
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/art-trading-corporation-ltd

コマースメディア

コマースメディア株式会社は、Shopifyを中心に、ECサイトのマーケティング・制作・運用・ロジスティクスまでを支援する企業です。日本で3社目のShopify Experts企業で、パートナー階層では「Premier Partner」に位置付けられています（2026年9月時点）。

自社でもShopifyストアを運営している経験を活かし、設定やデザイン、構築から、Amazon・楽天市場・Yahoo!ショッピングなどとの連携ソフトのつなぎ込みまで、包括的にサポートしています。国内向けECサイトの制作・ローカライズを得意としています。

制作・運営・物流の依頼先を一本化したい企業と相性のよい会社です。

会社概要

会社名	コマースメディア株式会社
設立	2016年5月
会社所在地	〒170-0005 東京都豊島区南大塚3丁目20-6 VORT大塚FTビル 2階
会社URL	https://commerce-media.info/
制作実績例	ドリアンマニア 公式通販サイト、モーモーパラダイス 公式ブランドサイト、Nigel Cabourn 日本公式サイト、ユニオン スクエア トウキョウ 公式ブランドサイト
Shopifyパートナー階層	Premier Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://commerce-media.info/pages/aboutus
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/commercemedia-inc

AnyMind Group

AnyMind Group株式会社は、ブランド企業やインフルエンサー・クリエイター向けに、EC・D2C領域を中心としたブランドコマース事業を展開している企業です。2026年9月には、Shopifyのパートナープログラムで「Premier Partner」に認定されたことを発表しました。2024年には、Shopify Japanによる「Shopify Partner of the Year 2024 – Japan」で「Rising Star Partner of the Year」を受賞しています。

ECサイトの制作・運用に加え、物流の「AnyLogi」、ものづくりの「AnyFactory」など、自社で複数のプロダクトを提供しているのが特徴です。商品の生産から販売、物流までを同じグループ内で相談できます。

会社概要

会社名	AnyMind Group株式会社
設立	2016年4月
会社所在地	東京都港区六本木6-10-1 六本木ヒルズ森タワー31F
会社URL	https://anymindgroup.com/ja/
制作実績例	再春館製薬、Nature 4 Nature、meross、MUSE
Shopifyパートナー階層	Premier Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://anymindgroup.com/ja/about/
＊参考　https://anymindgroup.com/ja/news/press-release/shopify-premier-partner-092026
＊参考　https://anymindgroup.com/ja/products/anylogi/
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/anyfactory

ごえん

ごえん株式会社は、岩手県北上市に本社を置き、EC事業の運営を支援している企業です。楽天市場・Yahoo!ショッピング・Amazon・Shopifyに対応した、EC事業支援のBPOサービスを提供しています。

受発注代行やカスタマー代行、コールセンター、フルフィルメントなど、ECの運営で発生するバックオフィス業務を幅広く請け負っているのが特徴です。2015年からはWEB制作事業も行なっており、ホームページの制作から運営まで相談できます。

モールと自社ECを並行して運営していて、受注処理や顧客対応の人手が足りない企業には、検討する価値があります。

会社概要

会社名	ごえん株式会社
設立	2013年12月
会社所在地	〒024-0012 岩手県北上市常盤台4-7-45
会社URL	https://goen-inc.com/
制作実績例	花工房パルテール、キエルキンショップファミール
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://goen-inc.com/about/

【運営代行・集客支援型】日々の運営と集客を任せられるShopify運用代行会社7選

運営代行・集客支援型は、商品登録やページ更新といった日々の運営作業や、広告・SNS・モール運営などの集客支援を得意とする会社です。すでにECサイトがあり、運営や売上づくりの人手が足りない企業に合っています。

いつも

株式会社いつもは、EC・D2C支援を手がける企業で、東京証券取引所グロース市場に上場しています。2007年の創業以来、EC事業者の売上拡大を支援してきました。

ECの戦略づくりから日々の運営まで、EC事業全体について相談できるのが特徴です。

Shopifyでの具体的な対応範囲は、問い合わせの際に確認することをおすすめします。

会社概要

会社名	株式会社いつも
創業	2007年2月14日
会社所在地	〒100-0006 東京都千代田区有楽町1-13-2 第一生命日比谷ファースト21階
会社URL	https://itsumo365.co.jp/
制作実績例	株式会社Polite、株式会社花助、株式会社メタボリック、株式会社クロスロード
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://itsumo365.co.jp/company/corporate.html

エスアンドティーパートナーズ

エスアンドティーパートナーズ株式会社は、大阪に本社、東京に支社を置き、ECサイトの制作と運営を支援している企業です。

自社EC・Shopifyのサイト制作や運営代行に加え、SNS運用、楽天市場・Amazon・Yahoo!ショッピングの運営、広告運用、EC経費の削減、物流まで、ECに関わる領域を幅広く扱っています。

自社ECとモールの両方を抱え、集客とコストをまとめて見直したい場合に頼りやすい会社です。

会社概要

会社名	エスアンドティーパートナーズ株式会社
設立	2012年9月3日
会社所在地	〒531-0072 大阪府大阪市北区豊崎3-19-3 ピアスタワー13F
会社URL	https://stps.co.jp/
制作実績例	シルクドリバー株式会社、リキュエム、富永貿易株式会社
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://stps.co.jp/company/info/

セルフプラス

Shopify運用支援の料金を月額20万〜80万円（税別）の4プランで公開しているのが、株式会社セルフプラスです。月額は、AIが担当する作業量を人手に換算した工数で決まります。最低契約期間は3ヶ月です。

ShopifyとecforceのECサイト構築・運用支援を行なっており、Shopifyのパートナー階層では「Plus Partner」に位置付けられています（2026年9月時点）。AIを活用した分析・改善提案・サイト改修に力を入れ、AI検索への対策（AIO・LLMO・GEO）にも対応しています。

AI検索での露出まで視野に入れるなら、選択肢に入れておきたい一社です。

会社概要

会社名	株式会社セルフプラス
設立	2015年9月11日
会社所在地	〒179-0074 東京都練馬区春日町6-8-5
会社URL	https://self-plus.co.jp/
制作実績例	学校法人田島学園、株式会社VIDA Corporation、株式会社リアンコネクション、株式会社CHINTAI（現：株式会社エイブルホールディングス）
Shopifyパートナー階層	Plus Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://self-plus.co.jp/company/profile/
＊参考　https://self-plus.co.jp/pricing/shopify-ai-growth/
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/961

オタツー

月額5万円（税込5万5,000円）から運営業務を任せられるのが、株式会社オタツーの「定額EC運営代行」です。最も手軽な「ライト」プランは3ヶ月契約で、分析や施策の立案を依頼できるECコンサル（月額15万円〜）も用意されています。

同社は2010年に設立されたEC運営代行の会社で、東京・南青山と岩手県奥州市に拠点を置いています。支援実績は4,000件以上。Shopifyによる自社ECの構築代行から、楽天市場などのモール運営まで幅広く対応しています。

小さく始めて、効果を見ながら依頼範囲を広げたい場合に使いやすいプランです。

会社概要

会社名	株式会社オタツー
設立	2010年9月29日
会社所在地	〒107-0062 東京都港区南青山4-20-4 ホリアージュ南青山1F
会社URL	https://ota2.jp/
制作実績例	パロマプラス、株式会社日山コーポレートサイト、華やぎおせち百花、日山オンラインショップ
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	要相談

＊参考　https://ota2.jp/company/
＊参考　https://ota2.jp/ec-subscription/

サヴァリ

サヴァリ株式会社は、楽天市場やAmazonなどのモール運用代行を中心に、EC・D2C事業を支援している企業です。

ネットショップの運営代行に加えて、楽天市場内での広告運用・分析といった楽天SEO対策から、ウェブ制作まで、ネットショップをトータルでサポートしています。

モールでの販売を強化しながら、自社ECを含めたEC事業全体の運営を相談できます。Shopifyでの対応範囲は、問い合わせの際に確認することをおすすめします。

会社概要

会社名	サヴァリ株式会社
設立	2007年9月10日
会社所在地	〒103-0004 東京都中央区東日本橋2-4-1 アドバンテージⅠビル 6階
会社URL	https://savari.jp/
制作実績例	雑貨 / メーカー、美容・家電、ヘルスケア/メーカー
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://savari.jp/

世界へボカン

世界へボカン株式会社は、越境ECと海外Webマーケティングに特化した企業です。Shopifyのパートナー階層では「Select Partner」に位置付けられています（2026年9月時点）。

海外市場の調査や戦略立案から、Shopifyでの越境ECサイトの制作・構築、英語でのリスティング広告運用、海外向けSNS（Instagram）の運用代行、翻訳まで、海外販売に必要な施策をまとめて依頼できます。Google Premier Partnerにも認定されています。

「日本の魅力を世界へ届ける」を掲げ、海外向けの販売と集客を支援しています。

会社概要

会社名	世界へボカン株式会社
設立	2014年8月28日
会社所在地	〒170-0013 東京都豊島区東池袋4-39-1 ナルハマビル3F
会社URL	https://www.s-bokan.com/
制作実績例	株式会社ビィ・フォアード、The Strike Gold、株式会社コッカ、株式会社つぐつぐ
Shopifyパートナー階層	Select Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://www.s-bokan.com/
＊参考　https://www.s-bokan.com/about/overview/
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/225

GMOグローバルEC（旧ジェイグラブ）

GMOグローバルEC株式会社は、日本企業の海外販売・海外展開を支援している企業です。2026年1月に、ジェイグラブ株式会社から社名を変更しました。

海外販売の開始から出店、物流、運用まで、目的に応じたサービスをワンストップで提供しています。自治体向けの支援にも対応しています。

海外販路の開拓を本格的に進めたい企業にとって、検討する価値があります。Shopifyを使った支援の範囲は、問い合わせの際に確認することをおすすめします。

会社概要

会社名	GMOグローバルEC株式会社（旧：ジェイグラブ株式会社）
設立	2010年2月4日
会社所在地	〒150-8512 東京都渋谷区桜丘町26-1 セルリアンタワー
会社URL	https://www.gmo-globalec.co.jp/
主要取引先（抜粋）	経済産業省、農林水産省、日本貿易振興機構（ジェトロ）、東京都
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://www.gmo-globalec.co.jp/company/

【制作・カスタマイズ型】開発・改修に強いShopify運用代行会社3選

制作・カスタマイズ型は、テーマのカスタマイズやアプリ開発、外部システムとの連携など、技術面の対応を得意とする会社です。機能の追加や改修を継続的に依頼したい企業に適しています。”

飛躍

株式会社飛躍は、Shopifyに特化したサービスを提供している企業です。Shopifyの日本参入初期からパートナーシップを結んでおり、パートナー階層では「Premier Partner」に位置付けられています（2026年9月時点）。

小規模から大規模までのECサイトの開発、グロース支援、アプリ開発など、Shopifyの技術面に強みがあります。越境ECの運営代行や、越境ECサイトの構築・カスタマイズにも対応しています。東京・六本木の本社に加え、2020年には京都支社を設置しています。

独自機能の実装や越境ECに取り組むなら、有力な候補になるでしょう。

会社概要

会社名	株式会社飛躍
設立	2017年9月
会社所在地	〒106-0032 東京都港区六本木7-18-8 第Ⅲ大栄ビル8F
会社URL	https://hiyaku-inc.com/
制作実績例	天狼院書店、バイロンベイミートパイ公式通販、クロノス CRONOS‐クロノス公式オンラインストア、オルタナオンライン
Shopifyパートナー階層	Premier Partner（2026年9月時点）
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://hiyaku-inc.com/pages/company-profile
＊参考　https://hiyaku-inc.com/pages/company
＊参考　https://www.shopify.com/partners/directory/partner/hiyaku-inc

フォーミックス

株式会社フォーミックスは、2004年に設立され、WebサイトやECサイトなどITサービス全般の企画、デザイン、システム開発、運用サポートを手がけている企業です。

システム開発の知見を活かし、Shopifyの構築から運用まで対応しています。フルフィルメントサービスも提供しており、物流まで含めた相談も可能です。自社の技術ブログでは、Shopifyの機能や連携アプリについての情報を継続的に発信しています。

会社概要

会社名	株式会社フォーミックス
設立	2004年4月
会社所在地	〒140-0002 東京都品川区東品川3-32-42 ISビル12F
会社URL	https://www.fourmix.co.jp/
制作実績例	THE DOG STORE、JAM STORE、オニツカタイガーオンラインストア
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客・物流支援

＊参考　https://www.fourmix.co.jp/
＊参考　https://www.fourmix.co.jp/aboutus/

アユース

アユース株式会社は、EC事業の戦略立案から実務の実行までをワンストップで支援している企業です。全国の現役ECプロフェッショナルと連携した「ECのプロ複業人材サービス」や、LINEを活用したCRMツールも提供しています。

Shopifyの制作代行・運用代行では、ブランディングを踏まえたデザインや、購入しやすいコンテンツの配置、導線の設計まで、ショップの運営を見据えたサイトづくりを行なっています。

ブランドの世界観を大切にしながら、売れるShopifyストアをつくりたい企業と相性のよい会社です。

会社概要

会社名	アユース株式会社
設立	2021年7月
会社所在地	〒104-0061 東京都中央区銀座1丁目12番4号 N&E BLD.6F
会社URL	https://ayouth.co.jp/
Shopifyパートナー階層	Partner Directoryで確認できず
Shopifyコンサル対応範囲	運用・改善・集客

＊参考　https://ayouth.co.jp/company/

まとめ

Shopify運用代行を選ぶときは、まず自社が「どこまで任せたいか」を決めることが大切です。構築から物流まで丸ごと任せたいなら総合型、日々の運営や集客を手伝ってほしいなら運営代行・集客支援型、機能の追加や改修を依頼したいなら制作・カスタマイズ型が候補になります。

そのうえで、料金や最低契約期間、Shopifyパートナー階層、物流やカスタマーサポートへの対応可否を比較し、自社に合う会社を選びましょう。

asnaroでは、Shopifyでのサイト構築から運営代行、集客支援、物流まで一貫してご支援しています。EC運営の窓口をひとつにまとめたい方は、お気軽にご相談ください。